航天工程系源于著名的“哈军工”导弹工程系，1970年组建哈尔滨船舶工程学院时，在“哈军工”导弹工程系和飞机工程系部分教师的基础上组建了哈尔滨船舶工程学院导弹工程系（后更名为航天工程系）。1978年招收本科生，现有“飞行器设计与工程”、“飞行器动力工程”、“工程力学”3个本科专业；具有“航空宇航科学与技术”一级学科硕士学位授权点和“固体力学”、“工程力学”、“一般力学与力学基础”、“飞行器设计”、“航空宇航推进理论与工程”、“工程热物理”7个硕士学位授权点；具有“力学”一级学科博士学位授权点和“固体力学”、“工程力学”、“一般力学与力学基础”3个二级学科博士学位授权点；设有“力学”博士后科研流动站。其中“固体力学”为国防科工委重点学科，“工程力学”专业为黑龙江省重点专业。

  该系现有教师30余人，博士生导师7人，教授10人，副教授和高级工程师7人。近年来共完成国家自然科学基金及其它基金项目和其它科研项目20余项，有多项科研成果获国家级和省部级奖，在结构可靠性、断裂损伤等研究领域处于国内先进水平。

飞行器设计与工程

  培养具备工程力学、流体力学及飞行器总体设计的基本理论和基本知识，具备从事飞行器总体设计、结构设计与研究、结构强度分析与实验和通用机械设计及制造的高级工程技术人才。

  开设的主要课程：材料力学、机械设计、结构力学、弹性力学、振动理论、流体力学、空气动力学、飞行器动力学、飞行力学、自动控制理论、飞行器总体设计、空间制导控制、传热学、热防护等。

  本专业是在我校原航天工程系导弹结构设计专业的基础上发展起来的，具有“航空宇航科学与技术”一级学科硕士学位授权点，1978年正式招生以来，毕业生中的许多人已成为航天及导弹方面的总设计师、研究员、高级工程师，为我国航空航天及国防事业做出了贡献。随着我国国防工业发展的需要，本专业毕业生就业主要到国防工业企事业单位、研究所、设计院、高校等部门，从事飞行器设计与工程方面的研究、设计、管理、教学等工作。

飞行器动力工程  

  培养具备飞行器动力装置或飞行器动力装置控制系统等方面的知识，具备从事飞行器动力装置及其它热动力机械的设计、研究、生产、实验、运行维护和技术管理等方面工作的高级工程技术人才。

  开设的主要课程：机械原理及机械设计、电工与电子技术、工程力学、自动控制原理、工程热力学、传热学、流体（含气体）力学、动力装置原理及结构、动力装置制造工艺学、动力装置测试技术等。

  本专业毕业生就业主要到国防工业企事业单位、研究所、设计院、高校等部门，从事飞行器动力工程   方面的研究、设计、管理、教学等工作。

工程力学

  培养具有力学基础理论知识、数值计算和实验技能，能够在多种工程实际（如机械、土建、材料、能源、交通、航空航天、船舶、水利、化工等）从事与力学有关的科研、技术开发、工程计算及教学工作的高级工程技术人才。

  开设的主要课程：理论力学、材料力学、流体力学、弹性力学、塑性力学、分析力学、结构力学、力学中的数学方法、振动基础、结构振动、非线性振动、随机振动、结构软件及工程应用、实验力学、动态测试方法等。

  本专业具有一般力学及力学基础和工程力学两个方向，学生可根据自身需要选择本专业及其他专业选修课程。

  通过本专业课程的学习，毕业生具有较扎实的自然科学基础、较系统的掌握本专业领域宽广的技术理论基础，主要包括固体力学、一般力学、工程力学及流体力学等基础知识；具有较强的解决与力学有关的工程技术问题的理论分析、数值计算与现代科学实验能力；具有较强的计算机和外语应用能力。

  本专业实力雄厚，具有工程力学和一般力学与力学基础硕士学位及博士学位授权点。本专业毕业生主要就业去向是航空航天及船舶工程企事业单位，从事飞行器设计与船舶研究、设计和管理工作。